◇◇新语丝(www.xys.org)(xys.dxiong.com)(xys1.dyndns.org)(xys.3322.org)◇◇ 云南师范大学副教授张田涉嫌剽窃 被剽窃论文:曾嵘,夏其昌. 2002. 蛋白质组学研究进展与趋势.中国科学院院刊, 3:166-169. 该论文收稿日期:2002年4月25日。(以下称曾文) 涉嫌剽窃论文:张田. 2003. 蛋白质与蛋白质组学的研究进展. 云南师范大学学 报, 1:51-53. 该论文收稿日期:2002年7月2日。(以下称张文) 详细对比这两篇论文,可发现文章结构几乎一模一样。个别地方属于换一种中文 表达方式,但论文主体部分(特别是从第二节开始)出现大面积、原模原样的抄 袭。更令人无法理解的是,甚至连参考文献也是剽窃而来的,这在剽窃当中应属 水平较低的一类。以下是两个人的简历: 曾 嵘 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所副研究员, 蛋白质组学重点实验室副主任,蛋白质组研究分析中心副主任。1995年毕业于湖 南师范大学生物系。2000年在中国科学院上海生物化学研究所取得博士学位。 1997年以来,发表有关蛋白质组学论文10余篇。 张 田(1961-),女,云南省昆明市人,云南师范大学副教授,近期主要从事脑功能 基因组学与蛋白质组研究. 结论:无论是从论文投稿、发表的日期,还是从两个人不同的简介,都可以看出 是谁剽窃了谁。另外,一位40余岁的副教授剽窃一位2000年才获得博士学位的年 轻人(1995年大学毕业),令人感到极不愉快。 涉嫌剽窃举例如下: 论文结构 曾文:                     张文 1蛋白质组学研究的意义和背景    1蛋白质与蛋白质组 2蛋白质研究的策略和范围      2蛋白质研究的内容和方法 3蛋白质研究技术          3蛋白质研究技术 3.1 蛋白质组研究中的样品制备   3.1蛋白质组研究中的样品制备  3.2蛋白质组研究中的样品分离和分析 3.2 蛋白质组研究中的样品分离和分析 3.3蛋白质组研究的新技术      3.3 蛋白质组研究的新技术 3.4蛋白质组生物信息学       3.4蛋白质组生物信息学 4 蛋白质组学发展趋势       4 蛋白质组学的形成与发展 原样照抄部分举例: 例1。曾文   通常可采用细胞或组织中的全蛋白质组分进行蛋白质组分析。也可以进行样 品预分级,即采用各种方法将细胞或组织中的全体蛋白质分成几部分,分别进行 蛋白质组研究。样品预分级的主要方法包括根据蛋白质溶解性和蛋白质在细胞中 不同的细胞器定位进行分级,如专门分离出细胞核、线粒体或高尔基体等细胞器 的蛋白质成分。样品预分级不仅可以提高低丰度蛋白质的上样量和检测,还可以 针对某一细胞器的蛋白质组进行研究。   对临床组织样本进行研究,寻找疾病标记,是蛋白质组研究的重要方向之一。 但临床样本都是各种细胞或组织混杂,而且状态不一。如肿瘤组织中,发生癌变的 往往是上皮类细胞,而这类细胞在肿瘤中总是与血管、基质细胞等混杂。所以,常 规采用的癌和癌旁组织或肿瘤与正常组织进行差异比较,实际上是多种细胞甚至 组织蛋白质组混合物的比较。而蛋白质组研究需要的通常是单一的细胞类型。最 近在组织水平上的蛋白质组样品制备方面也有新的进展,如采用激光捕获微解剖 (Laser Capture Microdissection,LCM)方法 分离癌变上皮类细胞[3]。 张文:   通常可采用细胞或组织中的全蛋白质组分进行蛋白质组分析。也可以进行样 品预分级,即采用各种方法将细胞或组织中的全体蛋白质分成几部分,分别进行蛋 白质组研究。样品预分级专门分离出细胞核、线粒体或高尔基体等细胞器的蛋白 质成分。样品预分级不仅可以提高低丰度蛋白质的上样量和检测,还可以针对某 一细胞器的蛋白质组进行研究。   对临床组织样本进行研究,寻找疾病标记,是蛋白质组研究的重要方向之一。 最近蛋白质组研究水平上的蛋白质组样品制备方面也有新的进展,如采用激光捕 获微解剖(Laser CaptureM icrodissection,LCM)方法分离癌变上皮类细胞。 例2  曾文 3.2 蛋白质组研究中的样品分离和分析   利用蛋白质的等电点和分子量通过双向凝胶电泳的方法将各种蛋白质区分开 来是一种很有效的手段。它在蛋白质组分离技术中起到了关键作用。如何提高双 向凝胶电泳的分离容量、灵敏度和分辨率以及对蛋白质差异表达的准确检测,是 目前双向凝胶电泳技术发展的关键问题。国外的主要趋势有第一维电泳采用窄p H梯度胶分离以及开发与双向凝胶电泳相结合的高灵敏度蛋白质染色技术,如新 型的荧光染色技术。   质谱技术是目前蛋白质组研究中发展最快,也最具活力和潜力的技术。它通 过测定蛋白质的质量来判别蛋白质的种类。当前蛋白质组研究的核心技术就是双 向凝胶电泳 质谱技术,即通过双向凝胶电泳将蛋白质分离,然后利用质谱对蛋白 质逐一进行鉴定。对于蛋白质鉴定而言,高通量、高灵敏度和高精度是三个关键 指标。一般的质谱技术难以将三者合一,而最近发展的质谱技术可以同时达到以 上三个要求,从而实现对蛋白质准确和大规模的鉴定。 张文 3.2蛋白质组研究中的样品分离和分析 利用蛋白质的等电点和分子量通过双向凝胶电泳的方法将各种蛋白质区分开来 是一种很有效的手段。国外的主要趋势有第一维电泳采用窄pH梯度胶分离以及开 发与双向凝胶电泳相结合的高灵敏度蛋白质染色技术,如新型的荧光染色技术。 质谱技术是目前蛋白质组研究中发展最快,也最具活力和潜力的技术。它通过 测定蛋白质的质量来判别蛋白质的种类。当前蛋白质组研究的核心技术就是双向 凝胶电泳-质谱技术,即通过双向凝胶电泳将蛋白质分离,然后利用质谱对蛋白质 逐一进行鉴定。 例3 曾文 3.3 蛋白质组研究的新技术 做过双向凝胶电泳的人一定会抱怨它的繁琐、不稳定和低灵敏度等缺点。发展 可替代或补充双向凝胶电泳的新方法已成为蛋白质组研究技术最主要的目标。目 前,二维色谱(2D LC)、二维毛细管电泳(2D CE)、液相色谱 毛细管电泳 (LC CE)等新型分离技术都有补充和取代双向凝胶电泳之势。另一种策略则 是以质谱技术为核心,开发质谱鸟枪法(Shot gun)、毛细管电泳 质谱联 用(CE MS)等新策略,直接鉴定全蛋白质组混合酶解产物。随着对大规模蛋白 质相互作用研究的重视,发展高通量和高精度的蛋白质相互作用检测技术也被科 学家所关注。此外,蛋白质芯片的发展也十分迅速,并已在临床诊断中得到应用。 张文 3.3蛋白质组研究的新技术做过双向凝胶电泳的人一定会抱怨它的繁琐、不稳定 和低灵敏度等缺点。发展可替代或补充双向凝胶电泳的新方法已成为蛋白质组研 究技术最主要的目标。目前,二维色谱(2D-LC)、二维毛细管电泳(2D-CE)、液相 色谱-毛细管电泳(LC-CE)等新型分离技术都有补充和取代双向凝胶电泳之势。以 质谱技术为核心,开发质谱鸟枪法(Shot-gun)、毛细管电泳-质谱联用(CE-MS)等 新策略,直接鉴定全蛋白质组混合酶解产物。随着对大规模蛋白质相互作用研究 的重视,发展高通量和高精度的蛋白质相互作用检测技术也被关注。此外,蛋白质 芯片的发展也十分迅速,并已在临床诊断中得到应用。 例4 曾文 3.4 蛋白质组生物信息学 蛋白质组数据库是蛋白质组研究水平的标志和基础。瑞士的SWISS PR OT拥有目前世界上最大、种类最多的蛋白质组数据库。丹麦、英国、美国等也 都建立了各具特色的蛋白质组数据库。生物信息学的发展已给蛋白质组研究提供 了更方便、有效的计算机分析软件。特别值得注意的是,蛋白质质谱鉴定软件和 算法发展迅速,如SWISS PROT、Rockefeller大学、UCS F等都有自主的搜索软件和数据管理系统。最近发展的质谱数据直接搜寻基因组 数据库,使得质谱数据可直接进行基因注释,判断复杂的拼接方式。随着基因组学 的迅速推进,会给蛋白质组研究提供更多更全的数据库。另外,肽序列标记的从头 测序软件也十分引人注目。 张文 3.4蛋白质组生物信息学   蛋白质组数据库是蛋白质组研究水平的标志和基础。瑞士的SWISS-PROT拥有 目前世界上最大、种类最多的蛋白质组数据库。丹麦、英国、美国等也都建立了 各具特色的蛋白质组数据库。生物信息学的发展已给蛋白质研究提供了更方便、 有效的计算机分析软件。特别值得注意的是,蛋白质谱鉴定软件和算法发展迅速, 如SWISS-PROT、Rockefeller大学、UCSF等都有自主的搜索软件和数据管理系统。 最近发展的质谱数据直接搜寻基因组数据库,使得质谱数据可直接进行基因注释, 判断复杂的拼接方式。随着基因组学的迅速推进,会给蛋白质组研究提供更多更 全的数据库。另外,肽序列标记的从头测序软件也十分引人注目。 (XYS20030702) ◇◇新语丝(www.xys.org)(xys.dxiong.com)(xys1.dyndns.org)(xys.3322.org)◇◇