举证阶段，方玄昌申请其学生和侄子等人出庭作证，证明他被袭后伤情严重。令人惊讶的是，肖传国庭上诘问证人，有如职业律师。

　　方玄昌的学生陈述完方玄昌遇袭当晚的就医情况后，各方轮流对证人发问。轮到肖传国时，他不紧不慢地开口：“你刚才反复说，你赶到医院时方老师刚刚苏醒过来，可你是怎么知道——方玄昌之前是昏迷的？”

　　证人显然对此细节问题缺乏心理准备，有些支吾，“是警察和医生……”“哪个警察？哪个医生？”未及证人思索，肖传国连声追问。竟问得证人一时语塞。

　　辩论

　　我明明是要实施故意伤害

　　法庭辩论阶段，方玄昌和其代理律师反复强调，检方控以寻衅滋事罪有误，肖传国并不是以殴打二方来破坏社会秩序。方玄昌认为，肖传国雇凶打人是对二人明确的恶意报复，应以故意伤害(重伤)未遂的重罪来追究肖传国，才不致轻判肖传国。

　　接下来肖传国发言，未料他一上来就说：“我完全同意方玄昌先生刚才说的，我就是故意伤害，不是寻衅滋事，我根本没想通过殴打两人，来让全国的质疑者闭嘴。我明明是要报复他们两个人才实施的故意伤害。”

　　肖传国的辩护人随即跟进，称肖的目的不是扰乱社会公共秩序，也未随意殴打他人，因此不符合寻衅滋事罪的构成要件。肖的行为确有违法之处，属于故意伤害行为，但因鉴定结论只是轻微伤，所以此案不属于刑事案件范畴，只是治安案件，应转由公安机关进行行政处罚。

　　基于辩方亮明无罪观点，法庭宣布简易程序进行到此，随即休庭。不过不多时，法院又通知各方当事人回院，继续开庭审理。

　　表态

　　对二方被打“很遗憾”

　　庭审进行到最后陈述时，肖传国神情激动地说，他从医30多年兢兢业业，没拿过红包回扣，没接受过病人的吃请，“是什么让我今天站在这里，这里有我要反思的。”

　　“我就是一个普通人，你侮辱了我的妻子，我的导师……一天站七八个小时手术，晚上上网一看全是骂你的话，你不可能无动于衷。”闻听此言，肖传国的妻子在旁听席上掩面啜泣。

　　肖传国最后称，他本人没有遵纪守法，应该受到惩罚，这件事对他是个教训，他对浪费这么多警力和司法资源感到遗憾，对方舟子、方玄昌被打很遗憾，对不起。